Казахстанско-Японский инновационный центр (КЯИЦ) является ведущим научно-исследовательским центром открытого типа по проблемам биологической, пищевой, экологической безопасности и биотехнологии.

Центр был создан в 2010 году на основании Меморандума с японскими концернами «JEOL», «Shimadzu» и Казахским Национальным аграрным университетом. Центр был открыт в сентябре 2010 года первым Президентом Республики Казахстан Н.А. Назарбаевым во время  его посещения Казахского национального аграрного университета в связи с его 80-летием.

В состав Центра входит четыре научно-исследовательские лаборатории:     
1) лаборатория инженерного профиля «Электронная микроскопия»,                                         
2) «Пищевая и экологическая безопасность».                                                                     
3)«Зеленая биотехнология и клеточная инженерия»                                                                                        

Казахстанско-Японский инновационный центр – это научно-исследовательский центр открытого типа, оснащенный современным аналитическим оборудованием и высококвалифицированными кадрами. Материально-техническая база центра позволяет проводить исследования на уровне микро- и наночастиц с использованием электронной микроскопии (просвечивающего и сканирующего), проводить NGS-секвенирование и генетический анализ методом SNP-генотипирования, хроматографический анализ (газовый,атомно-абсорбционный, жидкостный) качества продуктов, а также весь комплекс серологических и гематологических исследований.

В соответствии с Аттестатом аккредитации № KZ.T.02.2314  по ГОСТ ISO/IEC 17025-2019 КЯИЦ определяет содержание тяжелых металлов, микотоксинов, пестицидов, антибиотиков, жирно-кислотного состава, физико-химических показателей с выдачей официальных заключений.

В соответствии с областью аккредитации объектами оценки являются:
- крупный рогатый скот: подтверждение происхождения крупного рогатого скота (отцовство, материнство);
- молоко и молокосодержащие продукты: физико-химические показатели, микотоксины, пестициды, антибиотики, жирнокислотный состав;
- мясо, субпродукты, мясные и мясосодержащие продукты: пестициды, антибиотики;
- пищевая масложировая продукция: жирнокислотный состав;
- комбикорма, комбикормовое сырье: физико-химические показатели, микотоксины, пестициды;
- зерно, используемое для кормовых целей: микотоксины, пестициды.

Лаборатория инженерного профиля «Электронная микроскопия»
Лаборатория инженерного профиля (ЛИП) «Электронная микроскопия» создана решением Ректората от 23 февраля 2009 года в соответствии с приказом МОН РК №58-пр. от 03.04.2008 г.
В 2015 г. лаборатория инженерного профиля «Электронная микроскопия» была аккредитована в системе аккредитации Республики Казахстан на соответствие требованиям СТ РК ИСО/МЭК 17025-2007 «Общие требования к компетентности испытательных и калибровочных лабораторий».


Лаборатория пищевой и экологической безопасности 
Лаборатория пищевой и экологической безопасности выполняет исследования биологических и неорганических, пищевых и экологических объектов. Возможности спектрометрических, хроматографических приборов лаборатории позволяют проводить химический анализ и определять показатели качества и безопасности сельскохозяйственного сырья и пищевой продукции согласно национальным и международным стандартам.

В 2020 г. лаборатория аккредитована в системе аккредитации Республики Казахстан на соответствие требованиям СТ РК ИСО/МЭК 17025-2019 «Общие требования к компетентности испытательных и калибровочных лабораторий».


Лаборатория Зеленой биотехнологии и клеточной инженерии
Лаборатория Зеленой биотехнологии и клеточной инженерии выполняет исследования в области ветеринарной диагностики инфекционных болезней животных и биобезопасности, гематологические, биохимические и иммуноферментные исследования сыворотки крови животных, совершенствование существующих средств и методов лабораторной диагностики, включая молекулярно-генетические методы исследований (ПЦР), которые позволяют решать самые различные научные задачи - диагностика заболеваний вирусной и бактериальной природы, диагностика латентных форм особоопасных заболеваний, заболевания, обусловленные генетическими изменениями, выявление мутаций, генная экспрессия, однонуклеотидные полиморфизмы, копийность генов, абсолютное количественное определение НК, количественная оценка патогенов и ГМО.

В 2020 году лаборатория  аккредитована  на соответствие требованиям СТ РК ИСО/МЭК 17025-2019  «Общие требования к компетентности испытательных и калибровочных лабораторий».


Лаборатория микробиологической безопасности
Для функционирования лаборатории в полном объеме имеются коллекционные штаммы микроорганизмов Bacillus cereus B-0364, Bacillus mycoides B-0365, Bacillus Subtilis B-0366, Micrococcus flavus B-0367, Micrococcus luteus 9341 B-0368 депонированы ГУ «Национальный центр мониторинга, референции, лабораторной диагностики и методологии в ветеринарии» КГИ в АПК МСХ РК, лаборатория «Национальная коллекция депонированных штаммов микрооргнизмов» для определения остаточных количеств антибиотиков в различных субстратах, а также ряд штаммов микроорганизмов для идентификации возбудителей.