В университете созданы научные школы экономистов-аграриев, агрономов, ветеринаров, животноводов, лесоводов, инженеров под руководством академиков Т.И. Есполова, Р.Е. Елешева, С.Б. Байзакова, Н.П. Иванова, А.Г. Рау, Т.С. Садыкулова, Т.С. Сайдулдина, К.Б.Бияшева, С.А. Кешуова, Г.С. Шабдарбаевой, Ж.К.Тулемисовой, Ж.Ж. Сулейменова, Д.М.Алиханова и других. На базе названных научных школ проходят обучение студенты, магистранты и докторанты.

Являясь лидером аграрной науки университет создал крупную научную школу с целой плеядой выдающихся ученых. Их достижения - это более 60 новых сортов, гибридов и форм сельскохозяйственных культур и древесных растений, десятки уникальных пород, типов и линий животных и птиц, более 150 видов вакцин, диагностикумов, пищевкусовых и лечебных препаратов и продуктов, различные конструкции сельскохозяйственных машин, биогазовых, ветро-гидро-гелиоустановок и других механизмов. Достаточно указать, что сегодня в грубошерстном овцеводстве доля пород селекции ученых университета составляет 10%; поддержка эпизоотического благополучия в животноводстве осуществляется благодаря научным разработкам ученых университета.